Ryby, rośliny i mikroorganizmy wodne potrzebują do życia tlenu, który rośliny zielone produkują podczas fotosyntezy, jego zawartość w wodzie zależy od jej temperatury. Nasycenie wody tlenem powinno zawsze wynosić co najmniej 80% wartości podanych w tabelce; poniżej 50% zaczynają się kłopoty. Niedobór tlenu powoduje bledniecie ryb, brak apetytu, niepokój, chwytanie powietrza, zataczanie się i zwiększenie podatności na choroby.
| °C | 15 | 20 | 25 | 30 | 35 |
| 100% nasycenia | 10,6 mg/dm3 | 9,1 mg/dm3 | 8,3 mg/dm3 | 7,6 mg/dm3 | 6,9 mg/dm3 |
Przyczynami niedoboru tlenu mogą być:
-nieodpowiednie podłoże, mul, zanieczyszczony filtr
-zbyt duża liczba ryb lub ilość pokarmu
-oddychanie ryb i roślin nocą
-niedobór światła, zbyt mała ilość roślin
-(obumarłe) glony
-ślimaki zdechłe wskutek stosowania lekarstw dla ryb
-substancje wiążące tlen, np. lekarstwa
-zbyt wysoka temperatura.
Pomóc może:
-przewietrzanie
-częściowa wymiana wody
-wyeliminowanie czynników negatywnych
-czyszczenie filtra
-więcej roślin i światła.
Zużycie tlenu jest proporcjonalne do zanieczyszczenia wody związkami organicznymi. Bada się je, mierząc zawartość tlenu w próbce wody, którą następnie pozostawią się na 48 godzin w ciemności i temperaturze 25"C, po czym mierzy się ponownie stężenie tlenu i porównuje z wartością wyjściową. Ubytek ponad 20% tlenu jest już ostrzeżeniem; należy ustalić i wyeliminować jego przyczynę!